Structuurkwaliteit
In het Bovenscheldebekken is de structuurkwaliteit (hydromorfologische kwaliteitswaardering) van de meeste waterlichamen ontoereikend. De overige waterlichamen scoren matig, geen enkel Vlaams waterlichaam of lokaal waterlichaam van de eerste orde heeft een goede structuurkwaliteit.
Voor de Vlaamse waterlichamen scoort enkel de Zwalm - dat een natuurlijk waterlichaam is - een matige structuurkwaliteit (de Rone ook maar kent slechts een traject van 300 m binnen het bekken). De overige Vlaamse waterlichamen scoren allen ontoereikend.
De lokale waterlichamen scoren een stuk beter voor structuurkwaliteit. De Oossebeek, Leebeek, Rijtgracht en Stampkotbeek-Wallebeek hebben wel nog een ontoereikende structuurkwaliteit.